马洪雨，博士，教授，博士生导师，马来西亚登嘉楼大学访问教授、加州理工学院访问学者，入选2021年全球渔业学Top100高产作者榜单、斯坦福大学2021年度全球前2%顶尖科学家年度科学影响力榜单，任广东省环南海地区重要海水养殖品种开发利用国际联合研究中心主任、汕头大学-马来西亚登嘉楼大学虾蟹贝类联合实验室主任。兼任中国青蟹产业技术创新平台副主席、中国水产学会第十一届理事会水产生物技术与遗传育种专业委员会委员、中国青年科技工作者协会第六届理事会理事、中国高等教育学会第一届科技服务专家指导委员会委员、广东省青年科学家协会农业科学与技术专业委员会主任、广东水产学会第八届理事会水产养殖技术专业委员会副主任委员等。受聘为Frontiers in Marine Science副主编、Fishes编委、Molecular Biology Reports编委。
主要从事水产养殖与遗传育种学研究。主持科研项目28项（国家级5项、省部级10项），以第一作者或通讯作者在Environmental Chemistry Letters、Reviews in Aquaculture、Scientific Data、Aquaculture等期刊发表SCI论文90余篇，合作出版著作5部（副主编1部），以第一发明人获国际/国家发明专利14件，发布团体标准2项（第1位）。荣获中国产学研合作创新成果奖二等奖1项（第1完成人）、中国发明协会发明创业奖创新奖二等奖1项（第1完成人）、第11届澳门国际创新发明展金奖1项（第1完成人）、上海市科学技术奖二等奖1项（第3完成人）等科技奖励10余项。
主持教改项目6项（省级2项），合作出版教材1部（副主编），发表教改论文1篇，主持省级一流本科课程1门，指导学生团队入选 “三下乡”社会实践活动全国重点团队、广东省省级重点团队、广东青年大学生“百千万工程”突击队行动优秀示范项目。指导学生团队荣获第六届中国青年志愿服务公益创业赛全国银奖1项、中国国际大学生创新大赛全国铜奖1项、第十八届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛全国三等奖1项、第九届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛广东省金奖1项、第十七届“挑战杯”广东大学生课外学术科技作品竞赛广东省特等奖1项等近20项。培养博士后10名、博士生10名、硕士生24名。
承担科研项目：
[1] 广东省科技计划项目（对外科技合作平台），环南海地区重要海水养殖品种开发利用国际联合研究中心，主持；（编号：粤科函资字[2023]904号，执行期：2023.07-2026.06）
[2] 广东省科技计划项目（农村科技），青蟹高产新品系“两阶段”接力养殖模式示范与推广应用，主持；（编号：2023B0202010024，执行期：2023.01-2024.12）
[3] 广东省乡村振兴战略专项省级种业振兴行动项目，拟穴青蟹种质改良技术创新与高产新品种培育，主持；（编号：2022-SPY-00-014，执行期：2022.11-22025.10）
[4] 广东省渔业发展支持政策一般性转移支付资金项目，池塘虾蟹贝藻多营养层级综合养殖模式示范，主持；（编号：粤农农函[2022]1144号，执行期：2023.01-2023.12）
[5] 广东省科技计划项目（农村科技特派员），虾蟹繁育养殖关键技术创新与示范推广，主持；（编号：KTP20210376，执行期：2021.12-2024.11）
[6] 国家自然科学基金面上项目，Hox基因Ubx/Abd-A在拟穴青蟹幼体腹部变态发育过程中的功能研究，主持；（编号：42076133，执行期：2021.01-2024.12）
[7] 广东省普通高校重点领域专项项目（乡村振兴），青蟹高效繁育养殖技术示范与推广，主持；（编号：2020ZDZX1001，执行期：2021.01-2023.12）
[8] 广东省省级项目（人才项目），青蟹性逆转与杂交研究，主持；(编号：2019TX05N067，执行期：2020.07-2023.07)
[9] 广东省科技计划项目（国际科技合作领域），青蟹软壳蟹培育技术创新与示范推广，主持；(编号：2018A050506080，执行期：2018.12-2021.11)
[10] 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项子课题，拟穴青蟹基因组解析与性别特异SNP标记鉴定研究，主持；(编号：2018YFD0900201-3，执行期：2018.12-2022.12)
[11] 广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途），池塘工程化循环水养殖技术的创新与应用，主持；(编号：SDYY-2018-11，执行期：2018.07-2019.06)
[12] 国家自然科学基金面上项目，拟穴青蟹染色体性别决定机制研究，主持；(编号：31772837，执行期：2018.01-2021.12)
[13] 广东省省级项目（人才项目），青蟹性别特异分子标记筛选与性别鉴定技术的构建及应用，主持；(编号：人才办[2017] 5号，执行期：2017.04-2020.03)
[14] 国家级项目（人才项目），拟穴青蟹基因组与遗传育种，主持；(编号：组厅字[2015] 48号，执行期：2015.12-2018.12)
[15] 国家留学人员科技活动择优资助项目，拟穴青蟹IGFR2基因启动子区甲基化修饰及调控mRNA转录的机制研究，主持；(执行期：2015.03-2017.02)
[16] 上海市科技支撑项目，基于QTLs的拟穴青蟹分子辅助育种技术构建与应用，主持；(编号：15391900900，执行期：2015.07-2017.12)
[17] 上海市自然科学基金项目，IGF2基因多态性及其调控拟穴青蟹生长发育的分子机制研究，主持；(编号：14ZR1449700，执行期：2014.07-2017.06)
[18] 国家自然科学基金青年项目，拟穴青蟹生长性状相关分子标记、QTLs发掘及定位研究，主持；(编号：31001106，执行期：2011.01-2013.12)
发表学术论文：
[1] Noah Esmaeili, Ma Hongyu*, Sunil Kadri, Douglas R. Tocher. Protein and lipid nutrition in crabs. Reviews in Aquaculture, 2024, online available, doi: 10.1111/raq.12908.
[2] Waqas Waqas#, Yuan Ye#, Sardar Ali, Zhang Mengqian, Muhammad Shafiq, Wajid Ali, Chen Yongyi, Xiang Zifei, Chen Ruixiang, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Toxic effects of heavy metals on crustaceans and associated health risks in humans: a review. Environmental Chemistry Letters, 2024, online available, doi: 10.1007/s10311-024-01717-3.
[3] Wang Dahe, Yu Yang, Gao Weifeng, Xiang Zifei, Zhao Zilin, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Dynamic changes characteristics of spermatozoon during the reproductive process of mud crab (Scylla paramamosain): From spermatophore formation, transportation to dispersion. Aquaculture Reports, 2023, 33: 101866.
[4] Hafiz Sohaib Ahmed Saqib#, Yuan Ye#, Syed Shabi Ul Hassan Kazmi, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Salinity gradients drove the gut and stomach microbial assemblages of mud crabs (Scylla paramamosain) in marine environments. Ecological Indicators, 2023, 151: 110315
[5] Gao Weifeng#, Yuan Ye#, Huang Zhi, Chen Yongyi, Cui Wenxiao, Zhang Yin, Hafiz Sohaib Ahmed Saqib, Ye Shaopan, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Evaluation of the feasibility of harvest optimisation of soft-shelled mud crab (Scylla paramamosain) from the perspective of nutritional values. Foods, 2023, 12 (3): 583
[6] Ardavan Farhadi, Lv Ligang, Song Jun, Zhang Yin, Ye Shaopan, Zhang Ning, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Whole-transcriptome RNA sequencing revealed the roles of chitin-related genes in the eyestalk abnormality of a novel mud crab hybrid (Scylla serrata ♀ × S. paramamosain ♂). International Journal of Biological Macromolecules, 2022, 208: 611-626
[7] Ardavan Farhadi, Shi Xi, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. A novel imprinted gene (Sp-Pol) with sex-specific SNP locus and sex-biased expression pattern provides insights into the gonad development of mud crab (Scylla paramamosain). Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 727607
[8] Cui Wenxiao, Guan Mengyun, Md. Abu Sadek, Wu Fangchun, Wu Qingyang, Tan Huaqiang, Shi Xi, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Construction of a genetic linkage map and QTL mapping for sex indicate the putative genetic pattern of the F1 hybrid Scylla (Scylla serrata ♀ × S. paramamosain ♂). Aquaculture, 2021, 545: 737222
[9] Ardavan Farhadi, Fang Shaobin, Zhang Yin, Cui Wenxiao, Fang Huan, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. The significant sex-biased expression pattern of Sp-Wnt4 provides novel insights into the ovarian development of mud crab (Scylla paramamosain). International Journal of Biological Macromolecules, 2021, 183: 490-501
[10] Ardavan Farhadi, Cui Wenxiao, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. The regulatory mechanism of sexual development in decapod crustaceans. Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 679687
[11] Zhang Yin, Wu Qingyang, Fang Shaobin, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. mRNA profile provides novel insights into stress adaptation in mud crab megalopa, Scylla paramamosain after salinity stress. BMC Genomics, 2020, 21: 559
[12] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Nor Afiqah-Aleng, Julia Hwei Zhong Moh, Mhd Ikhwanuddin, Marina Hassan, Mohd Husin Norainy, Ma Hongyu*. Gonadal transcriptomic analysis of the mud crab Scylla olivacea infected with rhizocephalan parasite Sacculina beauforti. Genomics, 2020, 112 (5): 2959-2969
[13] Wu Qingyang, Khor Waiho, Huang Zhi, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Lin Feng, Ma Hongyu*. Growth performance and biochemical composition dynamics of ovary, hepatopancreas and muscle tissues at different ovarian maturation stages of female mud crab, Scylla paramamosain. Aquaculture, 2020, 515: 734560
[14] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative profiling of ovarian and testicular piRNAs in the mud crab Scylla paramamosain. Genomics, 2020, 112 (1): 323-331
[15] Fang Shaobin, Zhang Yin, Shi Xi, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Tan Huaqiang, Mhd Ikhwanuddin, Hongyu Ma*. Identification of male-specific SNP markers and development of PCR-based genetic sex identification technique in crucifix crab (Charybdis feriatus) with implication of an XX/XY sex determination system. Genomics, 2020, 112 (1): 404-411
[16] Wu Qingyang, Shi Xi, Fang Shaobin, Xie Zhuofang, Guan Mengyun, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Different biochemical composition and nutritional value attribute to salinity and rearing period in male and female mud crab Scylla paramamosain. Aquaculture, 2019, 513: 734417
[17] Khor Waiho, Shi Xi, Hanafiah Fazhan, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Fang Shaobin, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. High-density genetic linkage maps provide novel insights into ZW/ZZ sex determination system and growth performance in mud crab (Scylla paramamosain). Frontiers in Genetics, 2019, 10: 298
[18] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Gonadal microRNA expression profiles and their potential role in sex differentiation and gonadal maturation of mud crab Scylla paramamosain. Marine Biotechnology, 2019, 21: 320-334
[19] Shi Xi, Lu Jianxue, Wu Qingyang, Khor Waiho , Jude Juventus Aweya, Hanafiah Fazhan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Lin Fan, You Cuihong, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative analysis of growth performance between female and male mud crab Scylla paramamosain crablets: Evidences from a four-month successive growth experiment. Aquaculture, 2019, 505: 351-362
[20] Shi Xi, Khor Waiho, Li Xincang, Mhd Ikhwanuddin, Miao Guidong, Lin Fan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Jude Juventus Aweya, Ghazali Azmie, Juliana C. Baylon, Emilia T. Quinitio, Ma Hongyu*. Female-specific SNP markers provide insights into a WZ/ZZ sex determination system for mud crab Scylla paramamosain, S. tranquebarica and S. serrata with a rapid method for genetic sex identification. BMC Genomics, 2018, 19: 981
[21] Zhang Yin, Miao Guidong, Wu Qingyang, Lin Fan, You Cuihong, Wang Shuqi, Jude Juventus Aweya, Ma Hongyu*. Transcriptome sequencing and molecular markers discovery in the gonads of Portunus sanguinolentus. Scientific Data, 2018, 5: 180131
[22] Yang Xiaolong, Ikhwanuddin Mhd, Li Xincang, Lin Fan, Wu Qingyang, Zhang Yueling, You Cuihong, Liu Wenhua, Cheng Yinwei, Shi Xi, Wang Shuqi, Ma Hongyu*. Comparative transcriptome analysis provides insights into differentially expressed genes and long non-coding RNAs between ovary and testis of the mud crab (Scylla paramamosain). Marine Biotechnology, 2018, 20 (1): 20-34
[23] 马洪雨, 吴清洋, 谭华强, 吴芳春, 林锋. 青蟹种间人工杂交技术建立及杂种子一代表型和遗传特征鉴定. 汕头大学学报（自然科学版）, 2021, 36 (2): 59-66
[24] 马洪雨, 吴清洋, 林锋, 张建生, 石西, 邱丽华, 范嗣刚. 拟穴青蟹室内水泥池高效人工育苗技术研究. 科学养鱼, 2021, 2: 65-66
[25] 吴清洋, 林锋, 石西, 张建生, 邱丽华, 范嗣刚, 马洪雨*. 拟穴青蟹池塘生态高效养殖技术研究. 科学养鱼, 2020, 7: 62-63
[26] 马洪雨, 谭华强, 方少彬, 黄智, 沈卓辉, 沈卓坤, 张建生, 张健彬, 林锋, 吴清洋, Mhd Ikhwanuddin. 青蟹陆基高密度循环水养殖技术的建立与应用. 科学养鱼, 2019, 12: 61-63
[27] 马洪雨, 吴清洋, 石西, 张建生, 陆建学, 夏连军. 拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究. 科学养鱼, 2019, 2: 12-13
授权发明专利：
[1] 马洪雨，石西，苗贵东，章跃陵，刘文华，郑怀平，李升康. 一种基于PCR技术的拟穴青蟹遗传性别快速鉴定方法，国家发明专利，2023.03，ZL201810313736.2
[2] 马洪雨，石西，李升康，章跃陵，郑怀平，刘文华，方少彬. 一种拟穴青蟹高密度遗传图谱的构建方法，国家发明专利，2022.07，ZL201811315967.3
[3] 马洪雨，方少彬，吴清洋，石西，林帆. 一种锈斑蟳全基因组微卫星标记及筛选方法与应用，国家发明专利，2022.06，ZL201810593080.4
[4] 马洪雨，吴清洋，谭华强，方少彬，牛泽瑶，黄智. 一种拟穴青蟹与锯缘青蟹人工定向杂交方法，国家发明专利，2022.03，ZL202010152729.6
[5] 马洪雨，方少彬，管梦云，苗贵东，石西. 一种快速鉴定锈斑蟳性别特异分子标记和遗传性别的方法，国家发明专利，2022.03，ZL201810572161.6
[6] 马洪雨，吴清洋，石西. 一种拟穴青蟹蚤状幼体和大眼幼体的池塘培育方法，国家发明专利，2021.09，ZL201910022494.6
[7] 马洪雨，苗贵东，游翠红，杨小龙，程银伟，章跃陵，石西. 一种用于拟穴青蟹性别鉴定的SNP位点及其鉴定方法，国家发明专利，2020.11，ZL201710252419.X
[8] 马洪雨，吴清洋，苗贵东，郑怀平，李升康，游翠红，王树启. 一种远海梭子蟹多态性微卫星分子标记及鉴定方法与应用，国家发明专利，2020.08，ZL201711267397.0
荣获科研奖励：
[1] 2023年10月，荣获第11届澳门国际创新发明展金奖“青蟹种质资源创制与人工繁养体系创新及推广应用”，第一完成人
[2] 2023年08月，荣获中国发明协会发明创业奖创新奖二等奖“青蟹优良种质资源挖掘及“育繁推”关键技术创制与推广应用”，第一完成人
[3] 2022年01月，荣获中国产学研合作创新成果奖二等奖“青蟹优良性状遗传解析及高效养殖关键技术创建与应用”，第一完成人
[4] 2015年11月，荣获上海市科技进步奖二等奖“拟穴青蟹人工繁育养殖与种质资源开发关键技术研究及应用”，第三完成人
联系电话：0754-86503471 Email: mahy@stu.edu.cn
